ATmega328Pのヒューズ設定に関して。
以下問題ありませんでした。

UNO用ヒューズ書き込み をしたあと、 Duemilanove用ヒューズ再書き込み
Duemilanove用ヒューズ書き込み をしたあと、 UNO用ヒューズ再書き込み


Arduino Uno
Low Fuse 0xFF
High Fuse 0xDE
Extended Fuse 0x05

Arduino Duemilanove or Nano w/ ATmega328
Low Fuse 0xFF
High Fuse 0xDA
Extended Fuse 0x05

(http://www.codingwithcody.com/2011/04/arduino-default-fuse-settings/)

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